Moluscos como a lebre-do-mar (Aplysia spp.), búzios (Cypraea sp.), berbigões (Anomalocardia brasiliana) e mexilhões (Mytilus spp.) são residentes do manguezal. Alguns deles são filtradores de plâncton e vivem enterrados no sedimento lodoso, como a amêijoa (Lucina pectinata), ou fixados às raízes dos mangues, como a ostra-de-mangue (Crassostrea rhizophorae). Outros moluscos, a exemplo do turu ou buzano (Teredo spp.), perfuram troncos e madeiras, contribuindo com a reciclagem da matéria orgânica.

Foto: lebre-do-mar (Aplysia brasiliana)
Fonte: Bianca P. Vieira (Projeto Manguezal)


Foto: amêijoa ou lambreta (Lucina pectinata)
Fonte: labec.com.br

Entre os crustáceos, os mais conhecidos são as cracas e os caranguejos. Destacamos o aratu (Goniopsis cruentata), o marinheiro (Aratus pisonii), os chama-marés (Uca spp.), o guaiamum (Cardisoma guanhumi) e o uçá (Ucides cordatus). Estes animais montam tocas de lama ou vivem como arborícolas e alimentam-se de carne, folhas, algas e fungos.
Há também os siris, tanto o azul (Callinectes sapidus) quanto o vermelho (Callinectes danae), habitantes das margens lodosas até as áreas mais profundas do ecótono.
Os camarões de água doce, como o pitu (Metanephrops rubellus), são exemplo de animais semi-residentes, pois desovam nos manguezais e após certo estágio seus filhotes retornam aos rios. Tanto os camarões de água doce quanto os de salgada são vitais para o equilíbrio ecológico do manguezal.

Foto: caranguejo arborícola aratu (Goniopsis cruentata)
Fonte: Thais Gabriella R. da Silva (Projeto Manguezal)

Foto: caranguejo chama-maré (Uca thayeri)
Fonte: Bianca P. Vieira (Projeto Manguezal)

A população de anelídeos (como minhocas e poliquetas) também é visivelmente vasta nesse ecossistema.

Existe uma infinidade de insetos nos manguezais, entre os mais relevantes estão mutucas, maruins, mosquitos, mariposas, borboletas, besouros e abelhas, que inclusive são utilizadas na apicultura em manguezais.